RNase 4 Digestion and 3 End Repair Mix 50 réactions

La RNase 4 est une endonucléase d'ARN monocaténaire qui clive le 3' de l'uridine dans les séquences uridine-purine (sites de coupure : U/A et U/G). La digestion de l'ARN par la RNase 4 produit des oligonucléotides d'ARN à terminaison U qui contiennent des terminaisons cycliques 2', 3'-phosphate et/ou linéaires 3'-phosphate. Le mélange de digestion et de réparation d'extrémité 3' de la RNase 4 est une coformulation de la RNase 4 et de l'activité de réparation d'extrémité 3' de la polynucléotide kinase T4 pour produire un pool d'oligonucléotides d'ARN à terminaison U avec une terminaison 3'-hydroxy. La réparation supplémentaire de l'extrémité 3' des produits de digestion par la RNase 4 simplifie et améliore l'analyse de la couverture du séquençage de l'ARN et la cartographie des modifications par chromatographie liquide-spectrométrie de masse (LC-MS/MS). L'activité endoribonucléase RNase 4 tolère les modifications de la base uridine telles que les espèces pseudo-, N1-méthyl-pseudo-, dihydro- et 5-méthoxy-uridine (Ψ, m1Ψ, D et mo5U).